USFBiH ostvaruje svoje aktivnosti kroz sekcije.
Broj sekcija i njihovu aktivnost utvrđuje Predsjedništvo s osnovnim zadatkom unaprjeđenja naučno-istraživačkog i stručnog rada iz oblasti stomatologije. Sekcije imaju predsjednika, generalnog sekretara i Kolegij članstva. Predsjednik sekcije rukovodi kolegijem.
Sekcije u okviru USFBiH su sljedeće:
SEKCIJA ZA ORALNU HIRURGIJU
predsjednik sekcije: mr. sci. dr. Amer Bukvić
e-mail: dr.amer.bukvic@gmail.com
SEKCIJA ZA PREVENTIVNU I DJEČIJU STOMATOLOGIJU I JAVNO ORALNO ZDRAVLJE
predsjednik sekcije: mr.sci. dr. Damir Duratbegović
e-mail: spusfbih@gmail.com
SEKCIJA ZA STOMATOLOŠKU PROTETIKU
predsjednik sekcije: prof. dr. Sead Redžepagić
e-mail: sead.redzepagic@gmail.com
ORTODONTSKO DRUŠTVO FBiH
predsjednik sekcije: prof. dr. Enita Nakaš
e-mail: enitta@gmail.com
SEKCIJA ZA PARODONTOLOGIJU I ORALNU MEDICINU
predsjednik sekcije: doc. dr. sci. Indira Mujić Jahić
e-mail: imujic@sf.unsa.ba
ENDODONTSKA SEKCIJA
predsjednik sekcije: prof. dr. sci. Lajla Hasić Branković
e-mail: lajlabrankovic@gmail.com
SEKCIJA IZ OPŠTE STOMATOLOGIJE
predsjednik sekcije: dr. Selma Ćosović
e-mail: selmacosovic2@gmail.com